More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4243 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4243  ABC transporter related  100 
 
 		 609 aa  1159    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0535  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 569 aa  538  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3613  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 602 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.956845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1319  ABC transporter related  46.46 
 
 		 564 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6439  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 310 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0973055  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  30.59 
 
 		 598 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  28.52 
 
 		 618 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.74 
 
 		 582 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  30.71 
 
 		 615 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  38.49 
 
 		 606 aa  157  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  30.16 
 
 		 603 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  29.94 
 
 		 663 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.15 
 
 		 637 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  28.75 
 
 		 715 aa  154  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  28.48 
 
 		 601 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  31.51 
 
 		 732 aa  153  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 609 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  30.46 
 
 		 596 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  38.66 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.88 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  36.45 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.62 
 
 		 600 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  36.09 
 
 		 603 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.65 
 
 		 593 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  31.93 
 
 		 623 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.92 
 
 		 603 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  43.93 
 
 		 593 aa  150  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.21 
 
 		 613 aa  150  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.42 
 
 		 593 aa  150  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.12 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.18 
 
 		 613 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  28.28 
 
 		 598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  36.96 
 
 		 1717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.5 
 
 		 613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.01 
 
 		 618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  39.26 
 
 		 1228 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.33 
 
 		 618 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  38.95 
 
 		 643 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  38.19 
 
 		 599 aa  148  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  34.83 
 
 		 583 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  42.57 
 
 		 595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.74 
 
 		 1522 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.25 
 
 		 576 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 575 aa  147  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  25.2 
 
 		 573 aa  146  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.79 
 
 		 618 aa  146  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.3 
 
 		 611 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  36.15 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  37.08 
 
 		 581 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  37.04 
 
 		 637 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.74 
 
 		 613 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  25.2 
 
 		 573 aa  146  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.43 
 
 		 580 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  33.33 
 
 		 737 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.42 
 
 		 721 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.08 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.36 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.77 
 
 		 617 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.04 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  42.06 
 
 		 608 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.72 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.72 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.64 
 
 		 620 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.04 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  30.9 
 
 		 600 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  38.33 
 
 		 603 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  33.74 
 
 		 701 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.44 
 
 		 583 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  38.72 
 
 		 598 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.17 
 
 		 596 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  36.92 
 
 		 595 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.57 
 
 		 669 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.25 
 
 		 625 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.94 
 
 		 582 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.72 
 
 		 644 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.73 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  29.98 
 
 		 600 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  34.46 
 
 		 731 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  33.08 
 
 		 586 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.11 
 
 		 644 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  28.38 
 
 		 592 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  33.41 
 
 		 611 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.21 
 
 		 617 aa  144  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 636 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  36.84 
 
 		 577 aa  144  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.63 
 
 		 632 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.71 
 
 		 1284 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  25.43 
 
 		 597 aa  143  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.38 
 
 		 593 aa  143  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  28.51 
 
 		 695 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  28.76 
 
 		 601 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  33.65 
 
 		 1675 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  35.96 
 
 		 601 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  35.46 
 
 		 1230 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  32.89 
 
 		 613 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  35.4 
 
 		 672 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  28.55 
 
 		 610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.76 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>