163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0972 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  100 
 
 		 103 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.25 
 
 		 478 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.24 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  45.26 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  46.74 
 
 		 469 aa  87.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  44.21 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.21 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  44.21 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  45.16 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  44.21 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.01 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  48.1 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  46.91 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 		 983 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.31 
 
 		 452 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.29 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  38.37 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  39.02 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.65 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  40.54 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  39.51 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 		 429 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 		 429 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 		 429 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 984 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  38.75 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  38.16 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.76 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  36.47 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  36.47 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.57 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  33.72 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 960 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.37 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  45.45 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.36 
 
 		 963 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  46.81 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.05 
 
 		 984 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  39.74 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  32.97 
 
 		 937 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.12 
 
 		 976 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.8 
 
 		 985 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  34.94 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  33.77 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  33.77 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  33.77 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  33.75 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.72 
 
 		 995 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  37.04 
 
 		 984 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.9 
 
 		 984 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.35 
 
 		 987 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  33.33 
 
 		 1005 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.8 
 
 		 1009 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  35.53 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  32.93 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  32.93 
 
 		 987 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.18 
 
 		 1007 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.18 
 
 		 1007 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.33 
 
 		 1006 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  33.75 
 
 		 968 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  35 
 
 		 1003 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  33.33 
 
 		 1006 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.72 
 
 		 997 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.49 
 
 		 987 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.33 
 
 		 1009 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.72 
 
 		 999 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.33 
 
 		 1009 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.62 
 
 		 961 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.33 
 
 		 1008 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.03 
 
 		 999 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  33.72 
 
 		 909 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.53 
 
 		 974 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.61 
 
 		 1005 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.56 
 
 		 999 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.61 
 
 		 1004 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.61 
 
 		 1004 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.61 
 
 		 1004 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.33 
 
 		 997 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.33 
 
 		 1010 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  32.56 
 
 		 997 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  36.36 
 
 		 977 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  34.15 
 
 		 980 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.71 
 
 		 976 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>