115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1932 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  100 
 
 		 99 aa  200  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  51.11 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  55.29 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  51.11 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  55.95 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  53.26 
 
 		 99 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  61.54 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  61.9 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  56.96 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  60.76 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  60.53 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.24 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  47.19 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  52.56 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  53.33 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  47.37 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  47.19 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  57.14 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  57.14 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  47.5 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  54.43 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  51.81 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  45.88 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.28 
 
 		 591 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  52 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  44.05 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  43.21 
 
 		 983 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 		 984 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  42.5 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 		 429 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  45.21 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  49.33 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  43.59 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 		 429 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 		 429 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.57 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  35.63 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.63 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  50.68 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.63 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  35.23 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.78 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  61.9 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.48 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  46.15 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  34.09 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  34.09 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  42.5 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  35.11 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.35 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  52.05 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  52.05 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 960 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  34.09 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  41.1 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  35.9 
 
 		 469 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.03 
 
 		 452 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  32.58 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  29.79 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  31.46 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  50.68 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  37.18 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 452 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  30.23 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  30.23 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  36.36 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  35.35 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  29.55 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  31.82 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  31.46 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  29.07 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4224  ferredoxin  47.95 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4142  ferredoxin  47.95 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.0464627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  37.93 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  29.07 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  31.46 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  32.29 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  49.32 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  27.84 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  47.95 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  47.95 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4033  ferredoxin  47.95 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30.68 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  30.23 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 		 984 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 		 984 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>