119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4375 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  57.26 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  59.8 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  55.28 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  62.5 
 
 		 113 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  56 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  53.41 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  51.19 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  47.13 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  54.88 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  46.94 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  45.05 
 
 		 99 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  51.06 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  46.59 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  41.24 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  45.78 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  48.42 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  48.42 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  42.39 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.8 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  40.51 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  38.75 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 960 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  43.18 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.12 
 
 		 591 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.81 
 
 		 478 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  41.18 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.35 
 
 		 452 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  31.11 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 983 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  36.56 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  37.18 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.76 
 
 		 429 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  34.69 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  34.94 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  33.75 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.75 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  33.75 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  43.75 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.75 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 984 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  53.06 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  30.38 
 
 		 469 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  43.84 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  34.52 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.75 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  32.5 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  32.1 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  36.14 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  36.14 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  35.44 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  35.44 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  35.96 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  36.71 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  36.71 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  30.86 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  34.15 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  29.35 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  38 
 
 		 982 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  28.41 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 983 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 983 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  29.87 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 983 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 983 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  35.87 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 983 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 983 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.26 
 
 		 984 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  32.63 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  33.77 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 		 983 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  37 
 
 		 982 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 		 979 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.37 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30.38 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  34 
 
 		 952 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>