105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5918 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  64.63 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  62.82 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  56.96 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  57.32 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  48.19 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  50.65 
 
 		 110 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  50 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  50 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  50 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  49.35 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  49.33 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  52 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  49.33 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  48.75 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  46.34 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  48.75 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  44.94 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 983 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  52.78 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  48.24 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  44.57 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.75 
 
 		 478 aa  74.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.51 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  51.81 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  50.6 
 
 		 984 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  47.5 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  44.44 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  43.21 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  44 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  46.99 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.51 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  46.99 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  46.99 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  47.14 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.59 
 
 		 591 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  43.59 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  43.59 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  46.15 
 
 		 469 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  43.42 
 
 		 960 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  43.21 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  40.74 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  44.74 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.42 
 
 		 429 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.42 
 
 		 429 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  41.03 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.42 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  45.21 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  45.21 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  45.21 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  42.53 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  52.83 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  45.83 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 		 452 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  35.8 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  38.46 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  39.74 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  41.77 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  40.79 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  37.18 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.94 
 
 		 985 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  49.12 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  38.75 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.73 
 
 		 984 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  37.97 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  37.8 
 
 		 1005 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.48 
 
 		 986 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  37.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.36 
 
 		 976 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  39.66 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.62 
 
 		 452 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  36.78 
 
 		 937 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40 
 
 		 1009 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  40 
 
 		 1009 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  40 
 
 		 1008 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.94 
 
 		 987 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  35.44 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.25 
 
 		 963 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  34.21 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  38.36 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  33.72 
 
 		 925 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  36.25 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.57 
 
 		 997 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.93 
 
 		 984 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.33 
 
 		 998 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  48 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.57 
 
 		 997 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.8 
 
 		 997 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.77 
 
 		 989 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>