101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4415 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  55.34 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  61.9 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  53.54 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  54.88 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42.27 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  44.68 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  56.79 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  55.95 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  47.83 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  42.71 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  47.13 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  45.35 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  49.43 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  43.48 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  48.35 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  45.56 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  48.72 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  51.25 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  45.35 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  42.35 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  46.43 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  47.62 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  47.62 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  44.3 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  38.37 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  40.51 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.05 
 
 		 591 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 960 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  36.25 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.25 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  36.25 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  41.11 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  37.18 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.52 
 
 		 478 aa  60.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  35 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 983 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  42.31 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  35.9 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  46.55 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  46.55 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.75 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 984 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.11 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  37.35 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.18 
 
 		 452 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  42.31 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  43.1 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  33.94 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  38.55 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  48.94 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  27.66 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  30.3 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  29.07 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  38.16 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  29.55 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  29.55 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 959 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  30.86 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  36.84 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  28.57 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  32 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  39.74 
 
 		 826 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  29.76 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  34.62 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  29.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 960 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  31.4 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 960 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  28.89 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 960 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  31.4 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.05 
 
 		 788 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  39.02 
 
 		 797 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  42.67 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  42.67 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  34.88 
 
 		 823 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  28.41 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  45.16 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  27.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.24 
 
 		 985 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  33.66 
 
 		 609 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>