36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0926 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  51.67 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  51.67 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  47.69 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  43.28 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  46.15 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  41.79 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  43.55 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.55 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  40.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  40.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  40.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  40.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.83 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.88 
 
 		 478 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  42.42 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.06 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.73 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  43.28 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  38.81 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  34.33 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  39.71 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  40.82 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.88 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 960 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  52.63 
 
 		 77 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  37.88 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.9 
 
 		 591 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  52.63 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  46.43 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>