85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2065 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
132 aa  245  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  90.91 
 
 
77 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  90.91 
 
 
77 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  90.91 
 
 
77 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  89.61 
 
 
77 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  89.61 
 
 
77 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  89.61 
 
 
77 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4142  ferredoxin  84.42 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.0464627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4224  ferredoxin  84.42 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117463  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  83.12 
 
 
77 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  85.71 
 
 
77 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  84.42 
 
 
77 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  84.42 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4033  ferredoxin  84.42 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  54.32 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  59.21 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  52.56 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.53 
 
 
591 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  59.49 
 
 
98 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  44.05 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  40.23 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  41.03 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  42.86 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  50.77 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  38.37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  42.53 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  43.21 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  42.17 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  35.29 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  50.68 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.97 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  41.89 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  45.95 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  45.95 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.47 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
960 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  44.59 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.97 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  46.58 
 
 
126 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  42.47 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  36.71 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  33.68 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  33.7 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  41.43 
 
 
97 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  37.08 
 
 
130 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  37.66 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  56.82 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  42.65 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  42.65 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
983 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  38.36 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  38.96 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  37.04 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  36.36 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.21 
 
 
478 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.9 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
984 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  35.9 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  41.18 
 
 
95 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  36.36 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  33.33 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  46.43 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  44.19 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  35.8 
 
 
469 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  29.41 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  38.96 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.41 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  29.41 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  41.38 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  44.16 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  52.63 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  32.95 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  31.94 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>