75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6212 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  96.84 
 
 		 107 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  96.84 
 
 		 107 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  56.32 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  45.35 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  36.9 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  41.25 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  41.03 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  42.31 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.36 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  37.65 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 429 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 429 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.37 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  37.66 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.37 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  35.37 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  39.19 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.37 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.7 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  37.66 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.15 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  42.17 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.37 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40.51 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 983 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  43.1 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  39.47 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.51 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  37.68 
 
 		 469 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  39.24 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  38.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  38.96 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  41.33 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  33.33 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  41.1 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.25 
 
 		 988 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  38.96 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  35.53 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  35.06 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  37.66 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 960 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 984 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  34.67 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.37 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  34.62 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  47.54 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  34.67 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  35.23 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  46.67 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.43 
 
 		 591 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  34.57 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  33.73 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.18 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.38 
 
 		 963 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  34.67 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  37.88 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  35.82 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.34 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  32.91 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  37.33 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.73 
 
 		 992 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  38.6 
 
 		 937 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>