63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4436 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  53.61 
 
 
112 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  48.45 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  52.17 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  51.92 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  50.52 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  46.53 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  48.35 
 
 
96 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  49 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  51.16 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  51.14 
 
 
96 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  51.14 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  47.78 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  45.68 
 
 
115 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  46.67 
 
 
103 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  44.09 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  47.37 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  46.05 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  43.01 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  43.01 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  44.9 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  43.33 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  35.23 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.47 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  39.47 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  32.05 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.62 
 
 
110 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.62 
 
 
110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  35.62 
 
 
110 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.78 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.77 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  32.05 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  32.47 
 
 
110 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
983 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  36.99 
 
 
95 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.9 
 
 
452 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  37.5 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.05 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  37.18 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.65 
 
 
591 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  28.89 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  28.77 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
429 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  32.05 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.46 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  36.23 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  36.11 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  55.26 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
429 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  28.95 
 
 
103 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  36.47 
 
 
90 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
429 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  41.38 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  26.19 
 
 
98 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  29.07 
 
 
108 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>