91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4428 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  66.34 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  68.18 
 
 		 114 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  66.67 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  66.29 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  66.29 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  67.42 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  55.79 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  58.89 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  61.18 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  52.04 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  58.54 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  50.5 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  51.61 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  52.63 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  52.33 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  51.69 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  48.91 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  49.46 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  57.14 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  47.78 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  55.95 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  46.53 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  47.73 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  47.25 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  42.47 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  38.37 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  33.72 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.34 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  36.05 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  37 
 
 		 469 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  36.36 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  33.72 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  35 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  36.99 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 983 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  36.99 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.99 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.71 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  36.36 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  39.24 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  46.67 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  46.67 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.62 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.62 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  41.54 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  36 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  27.66 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  35.53 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  33.66 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.62 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  34.67 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  34.67 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.52 
 
 		 452 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  39.02 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.82 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  34.21 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 960 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  34.18 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 		 429 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 		 429 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 		 429 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  32.97 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  55 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  32.93 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  34.43 
 
 		 112 aa  42  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  32.91 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  37.74 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 591 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.24 
 
 		 478 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  33.77 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  55 
 
 		 77 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 994 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4033  ferredoxin  55 
 
 		 77 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  35.8 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  25.88 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 984 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.52 
 
 		 986 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  30.34 
 
 		 808 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4552  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.46 
 
 		 818 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>