63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2332 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  94.68 
 
 		 96 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  76.6 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  66.28 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  62.07 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  58.14 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  54.95 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  56.04 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  55.95 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  56.18 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  56.82 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  55.95 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  52.27 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  52.27 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  53.57 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  57.14 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  51.14 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  51.19 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  51.19 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  47.19 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  48.84 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  46.59 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  48.81 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  48.78 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.78 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  42.5 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  40.24 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  33.33 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.61 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  36 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  27.96 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  27.96 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  27.96 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.42 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  29.03 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  35.62 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  30.21 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  23.75 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  28.42 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  28.42 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.7 
 
 		 478 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  29.9 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  32.29 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.67 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 983 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  32.91 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  29.29 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  32.91 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 452 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  31.96 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 85 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.33 
 
 		 103 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  39.13 
 
 		 987 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  35.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  29.29 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  34.94 
 
 		 965 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.93 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  36.84 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>