36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6086 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 104 aa  209  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  93.27 
 
 		 104 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  84.47 
 
 		 106 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  62.75 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  60.78 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  60.42 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  61.96 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  58.82 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  49.46 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  52.58 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  52.58 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  52.58 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  48.96 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  54.12 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  52.94 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  48.81 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  47.67 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  47.62 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  46.91 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  43.01 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  36.05 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  39.73 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  33.72 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  31.46 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.62 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.71 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.71 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  35.71 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.58 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>