52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0153 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  96.12 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  60.4 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  58.16 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  60.78 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  60.78 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  57.84 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  58 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  50.53 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  51.09 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  48.39 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  52.94 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  52.22 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  47.73 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  49.41 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  48.89 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  52.38 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  51.22 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  51.19 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  49.41 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  46.05 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  40.26 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  34.67 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  39.47 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  31.63 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.59 
 
 		 452 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.91 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.67 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 983 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.34 
 
 		 987 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  37.35 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  26.74 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  29.21 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  31.4 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  31.51 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  34.72 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  32.47 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  34.18 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  30.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  30.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  36.71 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.4 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  37.33 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  37.33 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.77 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>