88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2941 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  59.6 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  58.59 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  58 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  61.96 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  58.82 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  57 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  54.9 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  51.69 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  53.76 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  51.06 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  52.69 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  51.06 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  52.87 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  52.87 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  52.27 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  51.16 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  48.28 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  47.19 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  47.19 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  47.19 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  47.13 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  43.33 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  41.57 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  42.86 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  39.29 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  32.61 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 983 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 		 452 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.75 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 986 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.44 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.62 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  37.04 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.56 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  37.04 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.62 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  37.97 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.96 
 
 		 429 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 		 429 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 		 429 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.18 
 
 		 788 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  30 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  31.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  31.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  35.56 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 994 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.12 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  34.57 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  26.97 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  30.12 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.82 
 
 		 478 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  34.62 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  35.06 
 
 		 899 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  30.67 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.18 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  32 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  32.22 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.05 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  29.35 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  29.21 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1611  NADH dehydrogenase subunit G  34.62 
 
 		 787 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0552  NADH dehydrogenase subunit G  34.62 
 
 		 787 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  28.89 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 		 979 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 984 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.37 
 
 		 997 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.36 
 
 		 823 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  33.77 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  35 
 
 		 959 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_768  hydrogenase subunit, ferredoxin-like protein  31.25 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1354  NADH dehydrogenase subunit G  32.56 
 
 		 929 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  29.33 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  29.35 
 
 		 625 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.24 
 
 		 900 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.33 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  28.75 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  32.05 
 
 		 358 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  32.89 
 
 		 782 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.89 
 
 		 782 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  44.74 
 
 		 99 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>