45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6587 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  84.47 
 
 		 104 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  81.55 
 
 		 104 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  57.84 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  57.84 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  61.54 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  54.9 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  55.56 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  48.91 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  54.44 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  54.55 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  52.22 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  52.58 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  52.22 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  52.94 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  51.76 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  45.36 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  46.59 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  49.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  54.67 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  46.59 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  44.09 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  48.65 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  36.05 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  41.43 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  36.99 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  37.66 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.23 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  33.7 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.93 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  31.4 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.15 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  38.46 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.71 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.71 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  35.71 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  31.25 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.62 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.38 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  36.99 
 
 		 469 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  29.55 
 
 		 99 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>