92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6007 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  224  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  67.11 
 
 
95 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  58.23 
 
 
85 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  51.16 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  54.55 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  51.95 
 
 
983 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  42 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  39.36 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.35 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  45 
 
 
96 aa  67  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.02 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  40.86 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  48.05 
 
 
984 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  38.04 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  42.31 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  39.47 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.47 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  39.47 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  41.03 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  41.43 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.73 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  39.73 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  39.73 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  38.78 
 
 
469 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  41.77 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  43.68 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  38.16 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  38.36 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  40.3 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  33.66 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  43.24 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  43.24 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
591 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  39.47 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.44 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.5 
 
 
452 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  40.79 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  40.74 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  36.78 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  38.96 
 
 
115 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  40 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  37.65 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  33.78 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  34.21 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  38.67 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  41.03 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  34.41 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  34.41 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  31.33 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  31.11 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.93 
 
 
452 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  42.47 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 
429 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  34.15 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  32.95 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  36.59 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
960 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  31.63 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  36.14 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  35.53 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 
429 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 
429 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  42.19 
 
 
107 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  32.61 
 
 
106 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  50 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  33.72 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  39.44 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.24 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.24 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  32.5 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  33.77 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.24 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  37.97 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  32.97 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  34.21 
 
 
101 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.24 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  29.87 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  35.14 
 
 
96 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>