145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3516 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  100 
 
 		 108 aa  220  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  67.65 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  66.67 
 
 		 104 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  34.18 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 		 452 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  37.93 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42.53 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 		 591 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  37.89 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  42.68 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.52 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.52 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.52 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  38.16 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  40.48 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  36.26 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  40.23 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  32.63 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  31.94 
 
 		 469 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 983 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  35.71 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  40 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  31.33 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  35.53 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  36 
 
 		 609 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 		 582 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  36.05 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  32.14 
 
 		 582 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  33.77 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.77 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  33.77 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  35.63 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.97 
 
 		 983 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 984 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  35.06 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  35.63 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.47 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  35.48 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 983 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 983 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  33.77 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  34.83 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 983 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 983 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 983 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  37.84 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 983 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 960 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  32.93 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  32.93 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2478  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  35.71 
 
 		 235 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0927823  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  34.67 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  34.67 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  34.44 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  30.14 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  34.15 
 
 		 586 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  23.75 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  32.91 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.35 
 
 		 959 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 		 979 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  32.47 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  32.05 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  32.1 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.63 
 
 		 452 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  38.67 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.95 
 
 		 984 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4224  ferredoxin  37.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4142  ferredoxin  37.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.0464627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 950 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  32.94 
 
 		 126 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 950 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  29.35 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  34.18 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 950 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.95 
 
 		 658 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  32.63 
 
 		 799 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  32.47 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  22.5 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  32.1 
 
 		 115 aa  43.5  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.53 
 
 		 973 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  33.73 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  37.33 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  47.5 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  31.25 
 
 		 582 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  31.65 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>