25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5072 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  100 
 
 		 85 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  47.95 
 
 		 469 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  36.99 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  36.99 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  38.96 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  38.96 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  38.96 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  30.14 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 		 960 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 983 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  39.73 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  38.36 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  43.28 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  39.44 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  39.74 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 984 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.91 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  46.81 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  45.16 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  48.98 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 478 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.11 
 
 		 429 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  40.3 
 
 		 107 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>