More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0830 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  887    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  40.92 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 430 aa  286  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 411 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 416 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 420 aa  279  7e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 418 aa  279  8e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 429 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 426 aa  276  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 424 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  39.28 
 
 		 424 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 419 aa  272  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 421 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 419 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 434 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 424 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 425 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 427 aa  269  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 425 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 429 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 420 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>