More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11230 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 
597 aa  1221    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  54.34 
 
 
592 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  68.29 
 
 
592 aa  836    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  68.29 
 
 
592 aa  836    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  65.28 
 
 
600 aa  814    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  68.29 
 
 
592 aa  836    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  67.17 
 
 
601 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  53.46 
 
 
603 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  52.85 
 
 
598 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  44.43 
 
 
608 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  42.91 
 
 
608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.42 
 
 
608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.14 
 
 
609 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.59 
 
 
612 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  42.52 
 
 
592 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.74 
 
 
600 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 
593 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.35 
 
 
630 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.53 
 
 
610 aa  352  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.19 
 
 
610 aa  346  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.45 
 
 
622 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 
596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.41 
 
 
608 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.12 
 
 
605 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.02 
 
 
598 aa  320  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 
621 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  34.83 
 
 
710 aa  289  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 
590 aa  286  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  33.28 
 
 
723 aa  280  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  33.99 
 
 
639 aa  270  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  31.39 
 
 
653 aa  245  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 
572 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
551 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
708 aa  203  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.04 
 
 
534 aa  194  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.85 
 
 
534 aa  194  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.84 
 
 
545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
512 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 
552 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.91 
 
 
535 aa  174  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  31.47 
 
 
512 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 
500 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 
500 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
549 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  27.16 
 
 
547 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 
535 aa  164  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  29.92 
 
 
501 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  27.92 
 
 
538 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
542 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  32.27 
 
 
557 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
586 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 
539 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.08 
 
 
538 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
517 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  30.17 
 
 
503 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
568 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 
981 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 
543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  29.34 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
551 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
539 aa  147  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 
507 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 
536 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.86 
 
 
517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.86 
 
 
517 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
807 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 
525 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  29.92 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.63 
 
 
537 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.73 
 
 
550 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.86 
 
 
517 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 
495 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  26.03 
 
 
991 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.67 
 
 
517 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
520 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 
520 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 
538 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.48 
 
 
517 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
527 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.31 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.94 
 
 
518 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 
527 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 
546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 
534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  29.18 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  25.83 
 
 
533 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 
549 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  29.11 
 
 
543 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  24.95 
 
 
576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  25.95 
 
 
575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>