More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7121 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 542 aa  1107    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  52.57 
 
 		 544 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  48.76 
 
 		 527 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  49.53 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  38.56 
 
 		 545 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  38.55 
 
 		 535 aa  303  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 549 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  38.67 
 
 		 550 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  36.81 
 
 		 538 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  36.25 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 		 551 aa  282  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.21 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.96 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 560 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 543 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0898  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 537 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.37 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 708 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.26 
 
 		 516 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.68 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.76 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.76 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  32.37 
 
 		 538 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.402279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.76 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  29.76 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.55 
 
 		 517 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.76 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.66 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.55 
 
 		 522 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.02 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.51 
 
 		 517 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 521 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.3 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 512 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.3 
 
 		 517 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.1 
 
 		 517 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.93 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 518 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.31 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 568 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 538 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.66 
 
 		 503 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 507 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 807 aa  177  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 504 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.38 
 
 		 514 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.37 
 
 		 576 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 553 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  28.77 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 498 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 536 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  28.83 
 
 		 575 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 514 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 500 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 518 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 539 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.6 
 
 		 570 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  26.76 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  29.12 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  28.83 
 
 		 575 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  28.99 
 
 		 575 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  28.47 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  28.47 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.8 
 
 		 575 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.13 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 502 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 531 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.07 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>