More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3512 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1088    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  50.76 
 
 		 551 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  50.19 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  51.39 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  50.7 
 
 		 532 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  50 
 
 		 525 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  49.32 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  49.32 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  48.84 
 
 		 526 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  51.07 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  51.07 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  51.07 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  51.54 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  47.73 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  49.71 
 
 		 501 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  48.64 
 
 		 522 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  48.84 
 
 		 502 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  47.54 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  47.54 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  45.16 
 
 		 518 aa  392  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  48.97 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 572 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 708 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  31.96 
 
 		 547 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.55 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 608 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.13 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.52 
 
 		 535 aa  177  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.94 
 
 		 517 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.13 
 
 		 517 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.15 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.33 
 
 		 621 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.32 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.94 
 
 		 517 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.06 
 
 		 534 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.06 
 
 		 534 aa  170  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.03 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.03 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.03 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.03 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.03 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.84 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.84 
 
 		 510 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.24 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.32 
 
 		 600 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 536 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 535 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.89 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.46 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  28 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.27 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.43 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.23 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.89 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 662 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.27 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 517 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 506 aa  163  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 807 aa  163  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.81 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.4 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.8 
 
 		 522 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 498 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.93 
 
 		 592 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.6 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.71 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.74 
 
 		 592 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.74 
 
 		 592 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.69 
 
 		 597 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 560 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.76 
 
 		 517 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.48 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 549 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.78 
 
 		 514 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.33 
 
 		 601 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 568 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 495 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.19 
 
 		 516 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>