More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1548 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  59.85 
 
 
551 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
557 aa  1120    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  79.45 
 
 
554 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 
539 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  44.25 
 
 
543 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  43.54 
 
 
525 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  41.02 
 
 
522 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  43.34 
 
 
532 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  47.6 
 
 
549 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  44.02 
 
 
512 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  41.49 
 
 
526 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  44.42 
 
 
501 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
532 aa  363  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  44.76 
 
 
503 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  43.45 
 
 
502 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  42.89 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  42.89 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
527 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
527 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
527 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
518 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
613 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 
572 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 
708 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.26 
 
 
534 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.32 
 
 
534 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.08 
 
 
538 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 
609 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
520 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
532 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0898  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 
537 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
506 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 
521 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.27 
 
 
597 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.8 
 
 
545 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 
512 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 
490 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.28 
 
 
516 aa  154  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  31.41 
 
 
547 aa  154  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.09 
 
 
514 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 
506 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
512 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
492 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 
509 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 
536 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
551 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
560 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
541 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 
509 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.79 
 
 
509 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 
603 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 
506 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
511 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.04 
 
 
510 aa  145  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
807 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27 
 
 
512 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 
508 aa  144  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
507 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
544 aa  143  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 
548 aa  143  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
546 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
585 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  26.37 
 
 
555 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  30.45 
 
 
2167 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.6 
 
 
517 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.6 
 
 
537 aa  140  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.25 
 
 
608 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
521 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.41 
 
 
550 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.29 
 
 
535 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 
538 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.29 
 
 
516 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.15 
 
 
517 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
564 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.6 
 
 
517 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.38 
 
 
517 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 
498 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  29.4 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
549 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
499 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.38 
 
 
517 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
505 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 
506 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 
552 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  29.01 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.2 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  30.43 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 
503 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 
511 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 
622 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.25 
 
 
513 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 
569 aa  134  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 
592 aa  134  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 
567 aa  134  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  27.26 
 
 
723 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  26.86 
 
 
553 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.75 
 
 
592 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>