More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2305 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  65.84 
 
 		 532 aa  713    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 525 aa  1070    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  72.85 
 
 		 527 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  72.85 
 
 		 527 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  65.39 
 
 		 532 aa  692    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  72.85 
 
 		 527 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  87.24 
 
 		 526 aa  945    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  53.2 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  50.7 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  50.7 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 539 aa  465  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 		 518 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  50 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  49.51 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  52.98 
 
 		 503 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  43.59 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  43.54 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  42.17 
 
 		 543 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  41.03 
 
 		 554 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  44.05 
 
 		 549 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 572 aa  203  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 708 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  34.95 
 
 		 550 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.11 
 
 		 534 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.9 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  28.63 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.43 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.44 
 
 		 538 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.73 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.16 
 
 		 608 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.17 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 525 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 509 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  26.52 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 532 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 544 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 549 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 518 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.71 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 508 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 541 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.19 
 
 		 537 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.89 
 
 		 516 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 506 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  26.91 
 
 		 506 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.82 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  26.72 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 568 aa  134  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 596 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 509 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  29.38 
 
 		 508 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 522 aa  133  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 546 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  29.09 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.51 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2837  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.336629  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.53 
 
 		 592 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.05 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.34 
 
 		 524 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 807 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  27.19 
 
 		 639 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.84 
 
 		 600 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 554 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.18 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 538 aa  130  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.34 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.34 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3532  AMP-binding enzyme  29.4 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  25.62 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.69 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 592 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.69 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  27.15 
 
 		 576 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 550 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 551 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  26.53 
 
 		 578 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>