More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2118 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 613 aa  1273    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 539 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 532 aa  220  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  32.39 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  31.02 
 
 		 526 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 551 aa  213  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  30.28 
 
 		 557 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  36.78 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  32.88 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  30.32 
 
 		 543 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  31.02 
 
 		 502 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 527 aa  187  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 527 aa  187  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 527 aa  187  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  30.85 
 
 		 500 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  30.85 
 
 		 500 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  27.44 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 518 aa  181  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  31.46 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  31.2 
 
 		 549 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.05 
 
 		 621 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.85 
 
 		 622 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  26.4 
 
 		 549 aa  144  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.98 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.44 
 
 		 538 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  26.22 
 
 		 549 aa  140  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.87 
 
 		 534 aa  138  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.87 
 
 		 534 aa  138  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.64 
 
 		 630 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  28.31 
 
 		 723 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  25.08 
 
 		 592 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  25.73 
 
 		 544 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 610 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 509 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  26.14 
 
 		 552 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.94 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.83 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.21 
 
 		 593 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 598 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.87 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 502 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  26.44 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 		 512 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  25.68 
 
 		 552 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.22 
 
 		 610 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  25.78 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 708 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.97 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  23.29 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.35 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  27.67 
 
 		 543 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.15 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  23.79 
 
 		 547 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.35 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.15 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 513 aa  124  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  25.32 
 
 		 560 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.01 
 
 		 517 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.27 
 
 		 600 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.68 
 
 		 608 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  25.49 
 
 		 547 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 504 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.8 
 
 		 592 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 508 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.8 
 
 		 592 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.6 
 
 		 545 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  27.27 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.3 
 
 		 608 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 541 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 532 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  24.59 
 
 		 560 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.85 
 
 		 592 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  26.15 
 
 		 560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  25.71 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  24.48 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  24.49 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 558 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.86 
 
 		 537 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.29 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.83 
 
 		 550 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.29 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.48 
 
 		 505 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  24.29 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.1 
 
 		 522 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  24.32 
 
 		 560 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  24.15 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  26.14 
 
 		 550 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  25.93 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  24.64 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.1 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.96 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>