More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3540 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 596 aa  1229    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  52.4 
 
 		 600 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  47.83 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  50 
 
 		 630 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  48.17 
 
 		 605 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  48.67 
 
 		 622 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  47.73 
 
 		 592 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  48.19 
 
 		 593 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  45.13 
 
 		 610 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  44.87 
 
 		 610 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  41.58 
 
 		 608 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.2 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 621 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.29 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.84 
 
 		 608 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.67 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 		 612 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 603 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  38.62 
 
 		 639 aa  335  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.98 
 
 		 592 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 600 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 592 aa  335  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.8 
 
 		 592 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.8 
 
 		 592 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.39 
 
 		 601 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  37.35 
 
 		 723 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 598 aa  323  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 		 590 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  35.38 
 
 		 710 aa  300  5e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  31.21 
 
 		 653 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 708 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  26.16 
 
 		 547 aa  173  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.55 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.55 
 
 		 534 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.09 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.24 
 
 		 517 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.05 
 
 		 517 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.24 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.05 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.24 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.2 
 
 		 538 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  31.5 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.87 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.23 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.57 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.36 
 
 		 522 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 543 aa  151  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  29.36 
 
 		 522 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 662 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.57 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.83 
 
 		 522 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 530 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 517 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.83 
 
 		 517 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.64 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.4 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 522 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.94 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.38 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.27 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.1 
 
 		 516 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  26.86 
 
 		 542 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  29.58 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 552 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  25.18 
 
 		 991 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.43 
 
 		 518 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 509 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  29.89 
 
 		 503 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 568 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3807  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 473 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00941755  normal  0.205802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  25.09 
 
 		 1005 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  25.09 
 
 		 1005 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.47 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_904  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  26.65 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000599139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.58 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  24.91 
 
 		 1005 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 981 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 539 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  27.32 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>