More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2060 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
535 aa  1077    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  55.3 
 
 
527 aa  558  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  52.47 
 
 
544 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  40.58 
 
 
545 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  41.08 
 
 
547 aa  326  5e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 
550 aa  323  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
552 aa  313  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 
549 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  40.34 
 
 
550 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  39.32 
 
 
535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
543 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
560 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0898  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
537 aa  280  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.96 
 
 
538 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.24 
 
 
534 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.24 
 
 
534 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.66 
 
 
509 aa  246  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
572 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
708 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
512 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.36 
 
 
517 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.16 
 
 
517 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.96 
 
 
517 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
517 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.16 
 
 
517 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.96 
 
 
517 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.62 
 
 
518 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
521 aa  208  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
512 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
539 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
541 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.96 
 
 
505 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
538 aa  203  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.75 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.96 
 
 
522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.75 
 
 
522 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  28.75 
 
 
522 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
517 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 
498 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
507 aa  200  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.54 
 
 
517 aa  200  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.75 
 
 
522 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  33.86 
 
 
538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.32 
 
 
537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 
546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  29.29 
 
 
547 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
537 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
544 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 
514 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 
536 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
546 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 
520 aa  194  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
490 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
513 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.66 
 
 
517 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5038  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
520 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  34.57 
 
 
501 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.8 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  34.36 
 
 
501 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
507 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 
509 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
568 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.83 
 
 
516 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
520 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 
1043 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
509 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
517 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.11 
 
 
514 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.27 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.71 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
539 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.47 
 
 
600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 
544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.67 
 
 
600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
509 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
553 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
534 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
540 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31 
 
 
503 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
501 aa  183  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 
513 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  30.6 
 
 
553 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
520 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
504 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  31.58 
 
 
500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 
662 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 
601 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>