More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4939 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 517 aa  1035    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  52.45 
 
 		 807 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.97 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.336629  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 		 554 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3532  AMP-binding enzyme  38.9 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  31.4 
 
 		 547 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2539  putative acyl-CoA synthetase  37.48 
 
 		 546 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 551 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 512 aa  250  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  35.03 
 
 		 535 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 543 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 537 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 549 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.37 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.33 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  34.65 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.47 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.13 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 566 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0898  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 537 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.26 
 
 		 517 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.13 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.31 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 499 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 662 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 521 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.63 
 
 		 538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 539 aa  233  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 520 aa  233  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  32.74 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  35.46 
 
 		 550 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.61 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 544 aa  230  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 519 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 510 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.06 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  33.06 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 514 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.64 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 506 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.64 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.85 
 
 		 522 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.64 
 
 		 505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 542 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 510 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.36 
 
 		 517 aa  223  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 510 aa  223  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 560 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 559 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 506 aa  223  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.64 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 584 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 549 aa  220  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 568 aa  220  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 532 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 513 aa  220  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 		 510 aa  220  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 		 510 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 582 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.18 
 
 		 518 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 532 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.04 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 552 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>