More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1163 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  54.92 
 
 		 592 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  53.46 
 
 		 597 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 603 aa  1232    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  52.63 
 
 		 600 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  54.56 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  54.56 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  54.56 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  52.3 
 
 		 601 aa  625  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  52.11 
 
 		 598 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.07 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.28 
 
 		 609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  42.69 
 
 		 608 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  42.42 
 
 		 608 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 612 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.89 
 
 		 630 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.26 
 
 		 600 aa  379  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.03 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.03 
 
 		 593 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.68 
 
 		 592 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.38 
 
 		 605 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.96 
 
 		 610 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.96 
 
 		 610 aa  353  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.96 
 
 		 596 aa  350  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.38 
 
 		 608 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.36 
 
 		 598 aa  314  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 590 aa  296  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  35.01 
 
 		 723 aa  290  7e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  34.33 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  30.66 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  31.67 
 
 		 710 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 572 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 		 708 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.32 
 
 		 534 aa  184  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.32 
 
 		 534 aa  183  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 512 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 551 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.52 
 
 		 545 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  26.93 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 539 aa  165  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 552 aa  163  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  28.16 
 
 		 547 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 568 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  29.4 
 
 		 554 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 981 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  27.98 
 
 		 538 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.82 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  30.3 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  29.84 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 549 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11700  acyl-CoA synthetase  26.86 
 
 		 999 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.257643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  28.75 
 
 		 501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  26.17 
 
 		 991 aa  145  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 537 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 543 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  28.04 
 
 		 500 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  28.04 
 
 		 500 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3517  acyl-CoA synthetase  25.32 
 
 		 989 aa  140  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  28.72 
 
 		 543 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.46 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.69 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.61 
 
 		 538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  24.91 
 
 		 1002 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.457495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 		 613 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  24.72 
 
 		 1005 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  24.72 
 
 		 1005 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 505 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 518 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.15 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  25.14 
 
 		 1005 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.95 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.31 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.7 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.31 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.31 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  27.58 
 
 		 532 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 662 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.54 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>