More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4081 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  57.12 
 
 		 592 aa  669    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  99.83 
 
 		 592 aa  1211    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  68.29 
 
 		 597 aa  853    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 592 aa  1214    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  78.22 
 
 		 600 aa  954    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 592 aa  1214    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  77.76 
 
 		 601 aa  958    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  56.45 
 
 		 603 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  46.25 
 
 		 608 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.27 
 
 		 609 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.44 
 
 		 612 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  44.48 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.6 
 
 		 608 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.04 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.62 
 
 		 630 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  40 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.82 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.88 
 
 		 608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.77 
 
 		 622 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.03 
 
 		 605 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 		 592 aa  352  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.8 
 
 		 596 aa  346  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  37.81 
 
 		 593 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.62 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.56 
 
 		 621 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 		 590 aa  313  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  34.34 
 
 		 710 aa  292  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  34.19 
 
 		 723 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  33.92 
 
 		 639 aa  276  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  33.11 
 
 		 653 aa  256  7e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.47 
 
 		 534 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.47 
 
 		 534 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 572 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 708 aa  203  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 544 aa  183  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 512 aa  180  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 549 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.12 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.94 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.39 
 
 		 535 aa  164  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  31.08 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  27.49 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0592  putative AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29458  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  30.12 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.32 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.76 
 
 		 517 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 		 981 aa  157  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  26.55 
 
 		 991 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  29.11 
 
 		 503 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.94 
 
 		 517 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.13 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.94 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  30.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 		 539 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 807 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.39 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  28.15 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 527 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1907  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 543 aa  150  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.13 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  28.94 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  29.23 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 546 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 507 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 490 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 		 537 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  24.39 
 
 		 1005 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 1002 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.457495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  24.21 
 
 		 1005 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  24.21 
 
 		 1005 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  28.75 
 
 		 557 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3517  acyl-CoA synthetase  25.19 
 
 		 989 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 513 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  27.8 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11700  acyl-CoA synthetase  25.33 
 
 		 999 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.257643 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.27 
 
 		 533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>