More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1267 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3517  acyl-CoA synthetase  51.93 
 
 
989 aa  980    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  51.81 
 
 
1002 aa  917    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.457495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  53.35 
 
 
1005 aa  985    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
981 aa  1957    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11700  acyl-CoA synthetase  51.24 
 
 
999 aa  952    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.257643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  53.24 
 
 
1005 aa  984    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  53.24 
 
 
1005 aa  984    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  51.68 
 
 
991 aa  980    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.43 
 
 
600 aa  165  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
592 aa  165  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.74 
 
 
601 aa  162  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.31 
 
 
592 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  24.96 
 
 
609 aa  151  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.12 
 
 
592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.12 
 
 
592 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.49 
 
 
597 aa  149  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.61 
 
 
600 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.15 
 
 
612 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 
622 aa  141  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 
603 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.96 
 
 
596 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.12 
 
 
630 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.45 
 
 
608 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.44 
 
 
605 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.05 
 
 
598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  25.17 
 
 
598 aa  118  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 
593 aa  118  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
539 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.05 
 
 
608 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.84 
 
 
592 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  26.71 
 
 
512 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  22.97 
 
 
590 aa  111  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.66 
 
 
610 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3795  alpha/beta hydrolase fold  24.93 
 
 
383 aa  108  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  22 
 
 
534 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.34 
 
 
534 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  25.31 
 
 
552 aa  104  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1241  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.7 
 
 
363 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.51 
 
 
610 aa  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
369 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  29.72 
 
 
355 aa  102  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  22.95 
 
 
621 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3975  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.3 
 
 
361 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 
517 aa  99  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1369  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27 
 
 
361 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1430  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1231  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1208  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1331  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1406  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1471  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  27.22 
 
 
500 aa  97.8  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  27.22 
 
 
500 aa  97.8  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1210  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.16 
 
 
361 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 
708 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  22.95 
 
 
498 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1232  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27 
 
 
361 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  23.6 
 
 
526 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  26.99 
 
 
608 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3995  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
465 aa  95.9  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  22.74 
 
 
549 aa  95.5  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 
520 aa  95.5  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.2 
 
 
608 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  26.45 
 
 
501 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  22.44 
 
 
549 aa  95.1  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  23.55 
 
 
525 aa  94  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  25.82 
 
 
503 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 
511 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  20.45 
 
 
554 aa  93.6  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  23.67 
 
 
560 aa  92.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4161  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
372 aa  92.8  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1359  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 
523 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  20.95 
 
 
547 aa  91.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  25.44 
 
 
723 aa  91.3  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  24.68 
 
 
639 aa  91.3  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  25.14 
 
 
532 aa  91.3  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  21.43 
 
 
552 aa  90.9  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  28.17 
 
 
354 aa  90.9  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1044  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.87 
 
 
361 aa  90.9  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  22.57 
 
 
653 aa  89.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  25.85 
 
 
543 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.49 
 
 
356 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
508 aa  88.6  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 
511 aa  88.6  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  24.92 
 
 
375 aa  88.2  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  25.57 
 
 
557 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  21.81 
 
 
662 aa  87.8  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  21.94 
 
 
552 aa  87.8  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  21.47 
 
 
549 aa  87.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  23.33 
 
 
530 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.95 
 
 
464 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.86 
 
 
503 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  21.76 
 
 
549 aa  86.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  24.76 
 
 
519 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0105  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  22.75 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  25.26 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  24.21 
 
 
525 aa  85.1  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  23.98 
 
 
537 aa  85.1  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>