More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2914 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
351 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  82.99 
 
 
352 aa  551  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  76.77 
 
 
358 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.03 
 
 
349 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.55 
 
 
361 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.55 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.06 
 
 
357 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.76 
 
 
357 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.06 
 
 
357 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.06 
 
 
357 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.38 
 
 
347 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.09 
 
 
347 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.97 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.79 
 
 
347 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
347 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
344 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.72 
 
 
332 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
335 aa  358  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
332 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
332 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
531 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
355 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
531 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
531 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
343 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
531 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
531 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.27 
 
 
531 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.27 
 
 
531 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.27 
 
 
531 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.27 
 
 
531 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
531 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
531 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  56.27 
 
 
531 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.27 
 
 
531 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
531 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
340 aa  331  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.45 
 
 
332 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
531 aa  328  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
332 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.26 
 
 
365 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
333 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
332 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
339 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
338 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.39 
 
 
344 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
338 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
341 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 
337 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
336 aa  263  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
336 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
340 aa  262  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
345 aa  262  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1771  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
332 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.983535  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
344 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
337 aa  260  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
337 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
340 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 
339 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
341 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
337 aa  255  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.15 
 
 
342 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.47 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
340 aa  252  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.25 
 
 
338 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.47 
 
 
338 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
341 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
337 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
337 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.47 
 
 
338 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
349 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1281  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.02 
 
 
336 aa  249  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
342 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.47 
 
 
349 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.47 
 
 
349 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.18 
 
 
352 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
338 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
341 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0064  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
346 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 
340 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
339 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
341 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
338 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
341 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1799  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
339 aa  247  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000601677  normal  0.211733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
338 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
338 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.48 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
349 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
337 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
352 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.26 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>