More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2131 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
344 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.86 
 
 
352 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.14 
 
 
361 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.89 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.28 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.96 
 
 
347 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.51 
 
 
357 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.54 
 
 
348 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.51 
 
 
357 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.99 
 
 
347 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.08 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.08 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.9 
 
 
347 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.69 
 
 
332 aa  352  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.55 
 
 
335 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
336 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.41 
 
 
336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
340 aa  326  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
340 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
365 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.92 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.15 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
531 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
531 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
531 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
531 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
531 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
332 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.2 
 
 
343 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.15 
 
 
332 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.85 
 
 
333 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
344 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
336 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 
340 aa  275  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.62 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
339 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 
342 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
349 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.41 
 
 
349 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.32 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
349 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.16 
 
 
345 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
338 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
349 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
338 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
337 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.4 
 
 
341 aa  258  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
337 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0337  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 
346 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
338 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
353 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
336 aa  256  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
349 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
341 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
341 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.4 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.15 
 
 
341 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 
337 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
341 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
338 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 
352 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 
347 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 
341 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.96 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
339 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
340 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
350 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
347 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
344 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 
340 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
341 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.66 
 
 
337 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
341 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
341 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
341 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 
342 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.43 
 
 
344 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>