More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0451 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  95.99 
 
 
349 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  88.83 
 
 
349 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
349 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  88.54 
 
 
353 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  95.42 
 
 
349 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  88.22 
 
 
349 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  96.56 
 
 
349 aa  693    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08350  anthranilate phosphoribosyltransferase  78.67 
 
 
349 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0791  anthranilate phosphoribosyltransferase  78.39 
 
 
349 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3945  anthranilate phosphoribosyltransferase  76.72 
 
 
348 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46120  anthranilate phosphoribosyltransferase  75.93 
 
 
348 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.97 
 
 
342 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0753  anthranilate phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
338 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
338 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.43 
 
 
346 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1647  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.41788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2320  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 
343 aa  355  6.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.073919  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.2 
 
 
379 aa  352  4e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.82 
 
 
352 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
340 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.47 
 
 
341 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2862  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
343 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
344 aa  319  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
344 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2573  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
355 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0532  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
355 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
343 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 
349 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
341 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2586  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.06 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
349 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.53 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
347 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0531  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.69558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3577  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0646  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3558  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1912  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3585  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0942  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2911  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.46 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0585  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0461  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 
343 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0437  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
343 aa  305  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2884  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2761  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3180  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0896  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0865  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3025  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0877823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3126  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal  0.587762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.01 
 
 
349 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
350 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1029  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
347 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.58 
 
 
350 aa  299  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
343 aa  299  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2563  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
350 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0973109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
344 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3461  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.94 
 
 
344 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1210  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
346 aa  295  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0268  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
340 aa  295  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000860573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.48 
 
 
338 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
339 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
341 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.01 
 
 
352 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.01 
 
 
352 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.13 
 
 
339 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
350 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3476  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
340 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.216089  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.66 
 
 
350 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.73 
 
 
341 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3243  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
338 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2844  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
338 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118515  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3877  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
345 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.15 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.49 
 
 
346 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0181  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
344 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
337 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
338 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
344 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
339 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
340 aa  275  7e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
337 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3719  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
343 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.741915  normal  0.947635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.91 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0159  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
337 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>