More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2223 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
343 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.57 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.28 
 
 
349 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.2 
 
 
342 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  65 
 
 
341 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2563  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.7 
 
 
350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0973109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2862  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 
343 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2573  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.4 
 
 
355 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0532  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.4 
 
 
355 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2884  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.18 
 
 
345 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
347 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3126  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.08 
 
 
345 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal  0.587762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2761  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.08 
 
 
345 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3461  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.64 
 
 
344 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.2 
 
 
344 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3180  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 
360 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.5 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.5 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0942  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0531  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.69558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 
367 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3558  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3577  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1912  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3585  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0646  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0461  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.81 
 
 
343 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2911  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 
343 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0437  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.81 
 
 
343 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.65 
 
 
341 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.87 
 
 
350 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1029  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.19 
 
 
347 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3025  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.53 
 
 
369 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3476  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.27 
 
 
340 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.216089  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0585  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.29 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1210  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.18 
 
 
346 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3877  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.99 
 
 
345 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.59 
 
 
341 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3719  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.06 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.741915  normal  0.947635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04003  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.95 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.46 
 
 
338 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0146  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
341 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0159  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
344 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0181  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.52 
 
 
344 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.27 
 
 
338 aa  348  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
340 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3945  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.01 
 
 
349 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.77 
 
 
350 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  49 
 
 
353 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 
349 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.46 
 
 
345 aa  319  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
349 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 
349 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2586  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
341 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46120  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
346 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
349 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08350  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.49 
 
 
349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251492 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
344 aa  309  5e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0791  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.49 
 
 
349 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
341 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
341 aa  302  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 
341 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2320  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
343 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.073919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
342 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0753  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
341 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.48 
 
 
345 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
352 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0268  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
340 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000860573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
343 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 
338 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.46 
 
 
341 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
346 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0226  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
339 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
344 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
344 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
349 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
341 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
338 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
336 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.9 
 
 
379 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.16 
 
 
338 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.9 
 
 
379 aa  279  5e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
340 aa  279  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
340 aa  278  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2768  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
340 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>