More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3180 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3025  anthranilate phosphoribosyltransferase  93.79 
 
 
369 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3180  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
360 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.18 
 
 
342 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2862  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.99 
 
 
343 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  79.48 
 
 
349 aa  567  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  79.48 
 
 
349 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3126  anthranilate phosphoribosyltransferase  84.01 
 
 
345 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal  0.587762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2573  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.35 
 
 
355 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0532  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.35 
 
 
355 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.7 
 
 
343 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2761  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.72 
 
 
345 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2884  anthranilate phosphoribosyltransferase  82.27 
 
 
345 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2911  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.87 
 
 
343 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0942  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0461  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.99 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0531  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.69558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3577  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3585  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3558  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0646  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1912  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.58 
 
 
343 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0437  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.99 
 
 
343 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 
347 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.11 
 
 
341 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.4 
 
 
367 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.16 
 
 
344 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.24 
 
 
350 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.16 
 
 
344 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.45 
 
 
344 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0585  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.78 
 
 
345 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.62 
 
 
341 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1029  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.31 
 
 
347 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04003  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.97 
 
 
345 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3476  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.16 
 
 
340 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.216089  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1210  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.26 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3719  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.21 
 
 
343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.741915  normal  0.947635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3461  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.82 
 
 
344 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 
343 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3877  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.54 
 
 
345 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0146  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.73 
 
 
341 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0159  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 
344 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0181  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.12 
 
 
344 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2563  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.83 
 
 
350 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0973109  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
341 aa  362  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.34 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
338 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
349 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
349 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
345 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
353 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3945  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.03 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
349 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
379 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
349 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
349 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
340 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08350  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.26 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.73 
 
 
352 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0791  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
349 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
338 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2320  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.073919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.53 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0753  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.76 
 
 
341 aa  301  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1647  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
369 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.41788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46120  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
348 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.4 
 
 
350 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
346 aa  291  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
340 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.78 
 
 
342 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.26 
 
 
342 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
341 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2586  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.25 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
338 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0268  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000860573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
352 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.41 
 
 
344 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 
345 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
352 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.76 
 
 
346 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
350 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.13 
 
 
341 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.97 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2855  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
341 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
343 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
344 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4197  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.65 
 
 
337 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0332622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
337 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4170  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 
337 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
350 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>