More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1408 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
337 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  75.52 
 
 
338 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.63 
 
 
338 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.43 
 
 
340 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.27 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
339 aa  437  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.02 
 
 
338 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.8 
 
 
344 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.48 
 
 
339 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 
341 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.86 
 
 
336 aa  424  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.58 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.31 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.1 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.2 
 
 
337 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.91 
 
 
338 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.53 
 
 
337 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.24 
 
 
337 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.24 
 
 
337 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.64 
 
 
337 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 
349 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.71 
 
 
342 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.53 
 
 
337 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.82 
 
 
344 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.36 
 
 
347 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
338 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.93 
 
 
338 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
338 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
345 aa  349  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3172  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.82 
 
 
341 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  0.202006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1799  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
339 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000601677  normal  0.211733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.99 
 
 
342 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.52 
 
 
544 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
347 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1879  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.807187  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2137  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.26 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312455  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
344 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1400  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.6 
 
 
339 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.444811  hitchhiker  0.00043291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
352 aa  292  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.58 
 
 
352 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
339 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
342 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
344 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
340 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
349 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
349 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
340 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
345 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
341 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
350 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
341 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
337 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
339 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
349 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.14 
 
 
338 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.38 
 
 
340 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
349 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0226  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
339 aa  275  7e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
350 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.13 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.76 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4170  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.05 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
341 aa  272  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
352 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4054  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
337 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.85 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.18 
 
 
349 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
349 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3581  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
343 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572943  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4197  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
337 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0332622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.98 
 
 
347 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
347 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0217  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
339 aa  267  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.07 
 
 
339 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
342 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.98 
 
 
350 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 
346 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
367 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
352 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2768  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.13 
 
 
340 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
336 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1340  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
339 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728969  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0073  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.51 
 
 
338 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
342 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2023  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
330 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08350  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.57 
 
 
349 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0158  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
376 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.0330567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
344 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0791  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.57 
 
 
349 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
344 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3945  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 
348 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>