More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3172 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3172  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
341 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  0.202006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  61.19 
 
 
341 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.65 
 
 
338 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.7 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.71 
 
 
339 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.56 
 
 
347 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.82 
 
 
337 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  61.19 
 
 
338 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
337 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  61.47 
 
 
342 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
338 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.05 
 
 
337 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
338 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
344 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.71 
 
 
340 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 
349 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
339 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.88 
 
 
339 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
337 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
337 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.91 
 
 
336 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
337 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
337 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
337 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.13 
 
 
344 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
337 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
347 aa  349  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.85 
 
 
340 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
345 aa  341  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 
345 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1879  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 
345 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.807187  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1400  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
339 aa  335  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.444811  hitchhiker  0.00043291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.07 
 
 
338 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.07 
 
 
338 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1799  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.08 
 
 
339 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000601677  normal  0.211733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.85 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.28 
 
 
340 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
349 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
352 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
352 aa  315  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
342 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2137  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.66 
 
 
544 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
350 aa  301  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
350 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
350 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.59 
 
 
342 aa  299  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0226  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
339 aa  298  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
346 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.57 
 
 
352 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.41 
 
 
350 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 
339 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 
340 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1671  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
349 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.78 
 
 
336 aa  292  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
349 aa  292  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
347 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 
341 aa  291  9e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
341 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
367 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.18 
 
 
341 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
338 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
339 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
338 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
349 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
340 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
349 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
339 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
344 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
349 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
349 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0217  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
339 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2855  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.58 
 
 
343 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2023  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
330 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
338 aa  279  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 
344 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 
344 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 
341 aa  279  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
349 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1340  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
339 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728969  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3624  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
366 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
346 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
341 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 
342 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46120  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.59 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0753  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0836  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.53 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0270172  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>