More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2467 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
339 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  84.82 
 
 
337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.66 
 
 
338 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  81.95 
 
 
341 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.04 
 
 
337 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.38 
 
 
337 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  80.71 
 
 
338 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.57 
 
 
344 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.26 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.28 
 
 
338 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.28 
 
 
338 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.99 
 
 
344 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.31 
 
 
337 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
339 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.18 
 
 
340 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.37 
 
 
339 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349859  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.37 
 
 
336 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.58 
 
 
342 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.64 
 
 
337 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
337 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
337 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.29 
 
 
349 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
337 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.3 
 
 
340 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.05 
 
 
337 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3172  anthranilate phosphoribosyltransferase  60.71 
 
 
341 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  0.202006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  58.04 
 
 
345 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 
347 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1799  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.64 
 
 
339 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000601677  normal  0.211733 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
338 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
338 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.34 
 
 
338 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1879  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.83 
 
 
345 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.807187  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.85 
 
 
338 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.22 
 
 
341 aa  322  8e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
544 aa  318  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
340 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.78 
 
 
345 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
341 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
341 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2137  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
345 aa  309  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312455  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.01 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
347 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1400  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.444811  hitchhiker  0.00043291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
338 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
344 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
344 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
352 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
346 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
341 aa  299  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
352 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
349 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
350 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
338 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.87 
 
 
352 aa  298  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
350 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.28 
 
 
350 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.19 
 
 
344 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.68 
 
 
339 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
345 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 
340 aa  292  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0226  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.63 
 
 
339 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4580  anthranilate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
353 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00120881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
341 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.73 
 
 
339 aa  288  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
339 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0593  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
349 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.973159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
341 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1340  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.06 
 
 
339 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728969  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4054  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 
337 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
350 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
342 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
349 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0454  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.293556 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1138  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.7 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0421  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4170  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4197  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0332622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0585  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.21 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.21 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.21 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
337 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1397  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
340 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000237469  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1062  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.85 
 
 
346 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0952658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>