More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1427 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
347 aa  704    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  76.85 
 
 
361 aa  494  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.39 
 
 
352 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  75 
 
 
357 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.71 
 
 
357 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.71 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  74.41 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  73.7 
 
 
357 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.67 
 
 
358 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.14 
 
 
349 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.78 
 
 
347 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.78 
 
 
347 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.43 
 
 
347 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.01 
 
 
347 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
351 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.9 
 
 
344 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
332 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.57 
 
 
340 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
335 aa  342  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
336 aa  326  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 
336 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.33 
 
 
365 aa  319  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
332 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
531 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
531 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
531 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
531 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 
531 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.43 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.73 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.73 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
355 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.04 
 
 
332 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
343 aa  291  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
344 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.57 
 
 
341 aa  275  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 
339 aa  275  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
338 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.77 
 
 
352 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 
337 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.79 
 
 
345 aa  265  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
338 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 
350 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
349 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
350 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.09 
 
 
341 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.91 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
338 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
337 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
344 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
344 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
337 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 
379 aa  260  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.55 
 
 
340 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  41 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  41 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.69 
 
 
337 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.65 
 
 
336 aa  258  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 
352 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0337  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
346 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
367 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
341 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
379 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
341 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.47 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.12 
 
 
342 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 
339 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3519  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
342 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1281  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.73 
 
 
342 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 
347 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
347 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1340  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 
339 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728969  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 
344 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
341 aa  249  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  41 
 
 
341 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  41 
 
 
341 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  41 
 
 
341 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1175  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
341 aa  249  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
338 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
339 aa  249  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>