More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0794 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
332 aa  674    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  79.22 
 
 
335 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  84.66 
 
 
336 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  84.05 
 
 
336 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.17 
 
 
332 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.95 
 
 
340 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.87 
 
 
332 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.57 
 
 
355 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.36 
 
 
332 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  65.06 
 
 
531 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  65.06 
 
 
531 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.76 
 
 
531 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.76 
 
 
531 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.76 
 
 
531 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  63.86 
 
 
531 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
531 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.57 
 
 
332 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.66 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.27 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
340 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.19 
 
 
361 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
365 aa  346  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
352 aa  342  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
343 aa  342  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.72 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.72 
 
 
351 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
347 aa  329  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
357 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.01 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.51 
 
 
357 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.72 
 
 
347 aa  325  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.01 
 
 
347 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.51 
 
 
357 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.69 
 
 
344 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
357 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
347 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.65 
 
 
348 aa  315  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
341 aa  262  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
350 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06921  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
344 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0742709  normal  0.398882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
349 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
352 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.79 
 
 
336 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.2 
 
 
336 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
340 aa  249  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4401  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.16 
 
 
347 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0950615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
352 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
345 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
347 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1308  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.73 
 
 
351 aa  245  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.297434  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09271  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
345 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.162631  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1733  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15761  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
340 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
338 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0258  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
345 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.75 
 
 
344 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2308  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.83 
 
 
356 aa  239  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.77 
 
 
349 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
341 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
337 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09081  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
344 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0986  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
351 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262246  normal  0.0969882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
343 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
338 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0712  anthranilate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
350 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.55 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10351  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
342 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.73 
 
 
340 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0709  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.2 
 
 
351 aa  235  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1151  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.49 
 
 
369 aa  235  8e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.79 
 
 
337 aa  235  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.21 
 
 
339 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1799  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000601677  normal  0.211733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3058  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
347 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3063  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
347 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
345 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.75 
 
 
352 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
347 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.94 
 
 
341 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
337 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.82 
 
 
341 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09061  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 
344 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0541679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>