More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2005 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  98.19 
 
 
332 aa  660    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
355 aa  720    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  84.64 
 
 
332 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  85.24 
 
 
332 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  85.54 
 
 
333 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  85.24 
 
 
332 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.73 
 
 
332 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  76.58 
 
 
531 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  76.28 
 
 
531 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  76.58 
 
 
531 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  76.88 
 
 
531 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  76.58 
 
 
531 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  76.28 
 
 
531 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
531 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  75.38 
 
 
531 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  63.25 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.57 
 
 
332 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
336 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.94 
 
 
336 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
340 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
340 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.71 
 
 
343 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.92 
 
 
352 aa  328  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
351 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
365 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.15 
 
 
344 aa  319  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
358 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.18 
 
 
349 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.38 
 
 
357 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
347 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.1 
 
 
348 aa  298  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
347 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06921  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0742709  normal  0.398882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.87 
 
 
338 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1151  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 
339 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
338 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
336 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 
337 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 
339 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
341 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
340 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.48 
 
 
338 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10351  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 
342 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
337 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.94 
 
 
340 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09271  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
345 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.162631  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0258  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.11 
 
 
345 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15761  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
370 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.07 
 
 
337 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
339 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.07 
 
 
338 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
338 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
337 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
338 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 
336 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.07 
 
 
338 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.2 
 
 
341 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.13 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 
338 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.75 
 
 
347 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
544 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 
344 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09061  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.11 
 
 
344 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0541679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
337 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4401  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
347 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0950615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
337 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 
343 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 
342 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2308  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 
356 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1175  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
341 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
347 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0986  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
351 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262246  normal  0.0969882 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09081  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
337 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3624  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 
366 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 
337 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>