More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1684 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
352 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  82.99 
 
 
351 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  78.55 
 
 
358 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.94 
 
 
349 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.39 
 
 
347 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.93 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.59 
 
 
357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.01 
 
 
357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.3 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.3 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.47 
 
 
347 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.18 
 
 
347 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.18 
 
 
347 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 
347 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.08 
 
 
361 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.86 
 
 
344 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
332 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
335 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
336 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
336 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
332 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.15 
 
 
343 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
332 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
340 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  328  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  328  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  329  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  329  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  328  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  328  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  328  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  54.09 
 
 
531 aa  328  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
531 aa  328  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.49 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
531 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.92 
 
 
355 aa  325  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
531 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
531 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
531 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
365 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.92 
 
 
531 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  56.16 
 
 
531 aa  318  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
332 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
338 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
339 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.39 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
341 aa  266  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.92 
 
 
347 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
338 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
336 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
337 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.91 
 
 
344 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.6 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
349 aa  258  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
341 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.09 
 
 
340 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
340 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.47 
 
 
337 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
340 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
339 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
339 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
338 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
338 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.79 
 
 
344 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
337 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.63 
 
 
342 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
352 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
337 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.76 
 
 
342 aa  249  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
344 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 
337 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 
341 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 
352 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0337  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
346 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 
338 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
338 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 
338 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1771  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
332 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.983535  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 
338 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
349 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
339 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.73 
 
 
337 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.4 
 
 
341 aa  245  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
338 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
342 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 
379 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.09 
 
 
379 aa  243  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
338 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.59 
 
 
337 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
339 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
341 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>