More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2452 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
361 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  76.85 
 
 
347 aa  478  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.39 
 
 
357 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.39 
 
 
357 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.39 
 
 
357 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.83 
 
 
358 aa  428  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.09 
 
 
347 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.22 
 
 
357 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  66.08 
 
 
352 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.94 
 
 
347 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.09 
 
 
347 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  68.55 
 
 
351 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.62 
 
 
348 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  67.35 
 
 
349 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.35 
 
 
347 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.14 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.19 
 
 
332 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
340 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
335 aa  352  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.38 
 
 
336 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
365 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
336 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
333 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
531 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.05 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.05 
 
 
332 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
332 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
332 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
343 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
531 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.34 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
343 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
339 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.65 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0337  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
346 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 
336 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.67 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
341 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.59 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
341 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
337 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
367 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
336 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1189  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
346 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0318107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
337 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
341 aa  249  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
341 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 
347 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
344 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 
338 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
338 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
347 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
349 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
341 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
342 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
352 aa  246  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0751458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2932  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
341 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336453  normal  0.763588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
341 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.32 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.96 
 
 
341 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.32 
 
 
344 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.32 
 
 
344 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
339 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
339 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.47 
 
 
338 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
341 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2495  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 
350 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0195643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
344 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
341 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
341 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
379 aa  239  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
340 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1099  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
338 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>