More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2831 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
340 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.63 
 
 
343 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
335 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.48 
 
 
340 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
332 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
365 aa  351  8e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.52 
 
 
336 aa  350  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.52 
 
 
336 aa  349  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
355 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
332 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
332 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.48 
 
 
332 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 
531 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 
531 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 
531 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 
531 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
531 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 
531 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
332 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
333 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  54.28 
 
 
531 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.64 
 
 
347 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.34 
 
 
347 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
332 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.04 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
352 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
344 aa  305  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.03 
 
 
357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.03 
 
 
357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
361 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  47.81 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
358 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
348 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.22 
 
 
351 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
347 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2095  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
342 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.388225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
337 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
344 aa  246  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
339 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.16 
 
 
344 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28937  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 
357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0103177  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14230  predicted protein  40.17 
 
 
357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105496  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 
338 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0709  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.76 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
345 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
340 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
339 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
337 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 
341 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
341 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1281  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 
336 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
337 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 
343 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
338 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.3 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.81 
 
 
344 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0451  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1671  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 
349 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
338 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
352 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
342 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2381  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.69 
 
 
350 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.49 
 
 
342 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0064  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 
346 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
339 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 
352 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0337  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.79 
 
 
346 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
337 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5114  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 
349 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
544 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.4 
 
 
340 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
347 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2320  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
343 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
344 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4782  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 
349 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.37 
 
 
337 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
341 aa  226  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1774  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.75 
 
 
337 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 
337 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.68 
 
 
338 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
338 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0986  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.73 
 
 
351 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262246  normal  0.0969882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>