More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1460 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
347 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  98.85 
 
 
347 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  97.69 
 
 
347 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  91.07 
 
 
347 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.09 
 
 
357 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.33 
 
 
357 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  83.38 
 
 
357 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  82.76 
 
 
357 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  82.47 
 
 
348 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.97 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  72.57 
 
 
358 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.09 
 
 
361 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  71.72 
 
 
347 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  70.38 
 
 
351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  69.71 
 
 
349 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
344 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.6 
 
 
340 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.01 
 
 
332 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.27 
 
 
335 aa  355  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
336 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  51.64 
 
 
340 aa  348  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
336 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 
343 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
531 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
531 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
531 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
531 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
531 aa  322  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
531 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  53.71 
 
 
531 aa  322  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
531 aa  322  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
531 aa  322  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
531 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
531 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
332 aa  319  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
332 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.27 
 
 
531 aa  318  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.79 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.79 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.79 
 
 
332 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1120  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.7 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.354816  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
339 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.57 
 
 
337 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
344 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
338 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
341 aa  272  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
338 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.6 
 
 
344 aa  269  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
341 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 
367 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4051  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
341 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
338 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
338 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
340 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
345 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
340 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1293  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
341 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.69 
 
 
341 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1146  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
341 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
349 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
339 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 
337 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
344 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 
337 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
341 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
338 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
341 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.14 
 
 
340 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5211  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.09 
 
 
337 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321887  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
338 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  43.38 
 
 
544 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1358  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 
341 aa  255  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1158  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1250  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1318  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000112506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.3 
 
 
338 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1138  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
341 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1956  anthranilate phosphoribosyltransferase  41 
 
 
352 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1442  anthranilate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
379 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2260  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
352 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1132  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
341 aa  252  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1395  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
341 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00625631  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0973  anthranilate phosphoribosyltransferase  44.41 
 
 
379 aa  252  7e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 
339 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.65 
 
 
347 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3846  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 
344 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
347 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 
340 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>