More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01237 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
531 aa  1083    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
531 aa  1083    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  96.99 
 
 
531 aa  1016    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
531 aa  1083    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  92.09 
 
 
531 aa  961    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  96.99 
 
 
531 aa  1016    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  96.99 
 
 
531 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  97.18 
 
 
531 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
531 aa  1083    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  99.81 
 
 
531 aa  1082    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  99.62 
 
 
531 aa  1080    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
531 aa  1083    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  97.36 
 
 
531 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1083    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  99.62 
 
 
531 aa  1080    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  78.92 
 
 
332 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  78.31 
 
 
332 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.18 
 
 
355 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.41 
 
 
332 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  79.82 
 
 
332 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.41 
 
 
333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.39508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2044  anthranilate phosphoribosyltransferase  77.41 
 
 
332 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1152  anthranilate phosphoribosyltransferase  62.65 
 
 
335 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0794  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
332 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003086  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.24 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02760  anthranilate phosphoribosyltransferase  64.55 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1058  anthranilate phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
340 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2831  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
340 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1933  anthranilate synthase component II  84.21 
 
 
192 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2668  anthranilate synthase component II  82.38 
 
 
193 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
544 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2173  anthranilate synthase component II  83.16 
 
 
192 aa  335  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2305  anthranilate synthase component II  81.58 
 
 
192 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2043  anthranilate synthase component II  82.11 
 
 
192 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1933  anthranilate synthase component II  82.11 
 
 
192 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2006  anthranilate synthase component II  81.58 
 
 
192 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1532  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 
530 aa  332  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1591  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
530 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0795732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0784  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
546 aa  327  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.919428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1684  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
352 aa  326  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0807  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 
546 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02290  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.18 
 
 
343 aa  320  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3524  anthranilate phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
365 aa  319  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.613071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2914  anthranilate phosphoribosyltransferase  56.27 
 
 
351 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.433416  normal  0.542217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2253  anthranilate phosphoribosyltransferase  55.65 
 
 
349 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2452  anthranilate phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
361 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1427  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
347 aa  306  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1588  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
344 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.455869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1460  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
347 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1526  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
347 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2803  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
357 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.702749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2703  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 
357 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1662  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 
357 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.507741  hitchhiker  0.0000492679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1518  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
347 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0895855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2724  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
357 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.950665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2405  anthranilate phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
348 aa  297  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0969  anthranilate synthase/para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase subunit  36.62 
 
 
538 aa  295  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3021  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
347 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1684  anthranilate synthase component II  35.66 
 
 
535 aa  288  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0351  anthranilate synthase component II  34.09 
 
 
531 aa  267  4e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0795  anthranilate synthase component II  61.31 
 
 
203 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02759  anthranilate synthase component II  58.5 
 
 
202 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003087  anthranilate synthase amidotransferase component  58.5 
 
 
202 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0395  anthranilate synthase component II  33.94 
 
 
533 aa  249  9e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.861809  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06921  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.16 
 
 
344 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0742709  normal  0.398882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2777  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
347 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000134722  hitchhiker  0.000003256 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1613  anthranilate synthase component II  33.47 
 
 
533 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0370  anthranilate synthase component II  33.74 
 
 
533 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1153  anthranilate synthase component II  60 
 
 
202 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
339 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 
338 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1151  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
369 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.4 
 
 
341 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
344 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
340 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1211  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
344 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.76 
 
 
339 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
347 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1059  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  60 
 
 
200 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
337 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
345 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
338 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
341 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2828  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.43 
 
 
338 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.517689  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
344 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 
337 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
341 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
337 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
349 aa  230  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2131  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.6 
 
 
340 aa  229  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 
343 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2496  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
338 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0780472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
343 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.13 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15761  anthranilate phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 
370 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
341 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
338 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2248  anthranilate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
338 aa  226  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10351  anthranilate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 
342 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>