171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2668 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2668  lysine exporter protein (LysE/YggA)  100 
 
 		 119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  59.48 
 
 		 197 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  54.7 
 
 		 200 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.54 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  55.56 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 		 209 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  56.64 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.85 
 
 		 202 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  52.54 
 
 		 203 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  52.21 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  50.93 
 
 		 203 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  44.54 
 
 		 201 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  50 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  48.67 
 
 		 208 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.67 
 
 		 217 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  47.5 
 
 		 199 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  45.38 
 
 		 212 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  46.22 
 
 		 204 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  45.79 
 
 		 212 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  47.5 
 
 		 204 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  51 
 
 		 202 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  49.07 
 
 		 203 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.23 
 
 		 227 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  49.51 
 
 		 204 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  43.48 
 
 		 214 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.02 
 
 		 206 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  46.23 
 
 		 207 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  41.8 
 
 		 202 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  38.66 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 		 205 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.17 
 
 		 205 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 		 205 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 200 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 213 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  40.34 
 
 		 199 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 		 205 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.41 
 
 		 208 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 204 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  41.88 
 
 		 206 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 		 204 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  44.86 
 
 		 200 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  50.57 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 		 204 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  42.98 
 
 		 196 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  40.34 
 
 		 204 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 206 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  40.34 
 
 		 199 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  45.95 
 
 		 206 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  40.34 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  38.33 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  41.18 
 
 		 204 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 199 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 206 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  46.59 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 199 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 199 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 199 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  51.04 
 
 		 199 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  42.2 
 
 		 209 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  45 
 
 		 216 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  44.14 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  44.14 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.44 
 
 		 201 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  43.59 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.52 
 
 		 219 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.55 
 
 		 276 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.96 
 
 		 213 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.34 
 
 		 205 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.24 
 
 		 211 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  41.12 
 
 		 200 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.81 
 
 		 209 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  43.24 
 
 		 206 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.32 
 
 		 211 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.55 
 
 		 207 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  41.76 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  43.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  42.86 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  43.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  43.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  43.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  43.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  43.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  44.14 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  36.45 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  43.36 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.44 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  40.66 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  45.22 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  42.24 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00177  arginine exporter protein  34.45 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  34.45 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  34.45 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  34.45 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  45.12 
 
 		 217 aa  80.1  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  41.67 
 
 		 205 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  36.52 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>