More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2332 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.95 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.47 
 
 
257 aa  268  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.13 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  39.31 
 
 
273 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 
263 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
263 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
263 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
263 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  38.89 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
287 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  34.42 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  36.6 
 
 
281 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
298 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.42 
 
 
283 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
281 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
263 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  34.98 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  34.72 
 
 
274 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  35.26 
 
 
255 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  34.26 
 
 
274 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.81 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.24 
 
 
532 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
254 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
536 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.84 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  34.98 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  35.26 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  30.71 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
283 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
273 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
273 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
269 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.22 
 
 
282 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
256 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.41 
 
 
279 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  29.53 
 
 
279 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
532 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
254 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  27.35 
 
 
282 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  27.35 
 
 
282 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  30.08 
 
 
256 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
275 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.96 
 
 
279 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
255 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
279 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
284 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.81 
 
 
262 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.84 
 
 
277 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 
283 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
264 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
282 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  32.92 
 
 
273 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
275 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  32.45 
 
 
273 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
273 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  31.47 
 
 
272 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
272 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
277 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
283 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
276 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
281 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
280 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
273 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
283 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
289 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0265  ABC transporter permease  33.47 
 
 
538 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
279 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
282 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  34.46 
 
 
528 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>